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游戏发生在2037年。 故事始于2036年2月6日，一场电脑失控的事故摧毁了世界各地许多大城市。这场巨大灾难被称为"2036问题"，但有人预测2038年还会发生类似事件。于是一群科学家利用盖亚超级计算机制造了一个"地球模拟器"来阻止它发生，但失败了，因为人类的出生潜力大幅下降。 科学家们随后将"阿雷西博信息"公式输入地球模拟器，成功将人类带入了另一个世界。他们起初很兴奋，直到意识到地球模拟器中的人类自己也创造了另一个地球模拟器。科学家们开始怀疑他们实际上只是更高层级生物所制造的地球模拟器的产物。 故事围绕黑客高冈波伦展开，他拥有像电子游戏一样的"保存与加载"能力。利用他的黑客触发系统，他可以干预周围的世界线。